皖南医学院从1958年办学伊始即创立了“卫生学教研室”；1985年更名“预防医学教研室”；2010年成立预防医学系；2013年成立公共卫生学院。公共卫生与预防医学学科根植于1958年建校即成立的“卫生学教研室”之上，经过六十七年的发展，学科目前形成横跨公共卫生学院、检验学院、人文与管理学院和医学信息等四个学院，覆盖医、理、工三个门类、依托安徽省高水平公共卫生学院、与“双一流”天津医科大学结对共建教育部高水平公共卫生学院项目、安徽省高校应用型高峰培育学科（公共卫生与预防医学）、“皖南医学院高校公共卫生危机管理安徽省哲学社会科学重点实验室”省级平台等，一级学科硕士授权点和硕士专业学位授权类别各一个的发展格局。在落实“立德树人”根本任务的同时，在传染病医防融合和综合救治体系建设、慢性疾病综合防治研究、卫生检验技术开发以及公立医院改革等领域逐步形成特色，为区域医疗卫生事业培养了一大批高素质公共卫生与管理人才。

本学科紧密围绕区域经济社会发展、居民疾病谱的变化以及皖南独特自然环境，发挥“医理”“医工”学科交叉优势，应用数据挖掘、大数据人工智能等技术，开展环境、社会、心理、行为以及遗传等因素对人群健康的影响及其关键防控措施的研究，构建具有自主知识产权的综合防制技术和协同救治体系，促进成果转化。