研究生学院成立于2013年4月，2016年12月成立研究生学院党委。学院组织实施校党委有关决策部署，负责学校研究生党建和思想政治教育工作，指导各研究生培养单位的研究生教育管理工作，组织开展学科学位点的建设和培育工作。研究生学院设有学院办公室、培养办公室、管理办公室、学科建设办公室、学位建设办公室5个科室，学院现有职工13人。

我校于1979年开始招收硕士研究生，1981年被国务院学位委员会批准为首批硕士学位授予单位。2013年成为教育部、国家卫计委首批“临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革”试点高校，2019年获批安徽省博士学位授予立项建设单位，2022年学校被评为省级研究生思想政治教育优秀高校，2024年获批安徽省博士学位授予立项重点建设单位。

现有临床医学、基础医学、药学、公共卫生与预防医学、法医学、生物学、马克思主义理论7个一级学科硕士学位授权点，临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学、应用心理、电子信息、生物与医药8个硕士专业学位授权类别，中西医结合基础1个独立二级学科授权点，涵盖医、理、工、法、教育学5个学科门类。目前临床医学为安徽省高峰学科，基础医学、药学、公共卫生与预防医学为安徽省高峰培育学科，病理学与病理生理学为安徽省特色学科，临床医学、药理学与毒理学学科进入ESI全球排名前1%，神经外科、神经内科、重症医学科、普外科为国家临床重点专科。目前学校在校硕士研究生1884名，现有硕士生导师1229名，研究生联合培养基地62家，覆盖“长三角”主要城市和我省所有国家级住院医师规范化培训基地。现为安徽医科大学、山东大学、广州中医药大学、安徽中医药大学、安徽师范大学、安徽理工大学博士研究生联合培养单位，现有博士生导师30名。

我校将立足当前实际、着眼未来发展，继续坚持“立德树人”根本任务，发挥创新引领核心作用，不断加强研究生思想政治教育，培养德才兼备创新人才。

（2024年10月更新）