皖南医学院弋矶山医院中医科于1973年创建，1981年被国务院学位委员会批准为首批中医《内经》（后改为“中医基础理论”）专业硕士学位授予点。目前，本科室拥有首批国医大师工作室、国家中医药管理局重点学科，并下设中国中医科学院博士后培养流动站，皖南医学院中西医结合专业硕士研究生培养点。2017年、2022年李艳教授被评选为第六、第七批全国老中医药专家学术经验继承工作指导教师。本科室是皖南地区新安医学传承的核心机构，拥有国家非物质文化遗产“张一贴内科”第14、15代嫡系传人。学派传人仝小林于2019年当选中国科学院院士。2024年牵头成立皖南中西医结合联盟。得益于李济仁大师的杰出贡献，本科室痹病学科传统优势明显，在中医药学界享有盛誉。

我科于2010年被遴选为安徽省重点专科专病“风湿病”建设单位，于2016年通过验收；2012年被遴选为国家中医药管理局“中医痹病学”重点学科建设单位。在建设过程中，科室临床水平进一步提升，病人来自美国、澳大利亚、中国香港等多个国家和地区。中央电视台等权威媒体对我科临床工作成果进行了多次专题报道。

本学科目前拥有安徽省多糖工程技术研究中心、重大疾病非编码RNA转化研究安徽普通高校重点实验室三个省级科研平台，实施开放共享机制，全部向本学科工作人员、学生开放，经培训获操作合格证后，大部分仪器可自行使用，对本学科有着重要的支撑作用。另有国医大师李济仁工作室、全国名老中医药专家李艳传承工作室、北京中医药薪火传承“3+3”工程李济仁门诊李艳传承工作室、安徽省名医李艳工作室，校级研究机构中西医结合研究中心、新安医学研究中心等多个科学研究机构，目前拥有细胞筛选、免疫印迹、免疫荧光、临床样本库、动物实验等平台。