研究生学院成立于2013年4月，2016年12月成立研究生学院党委。学院组织实施校党委有关决策部署，负责学校研究生党建和思想政治教育工作，指导各研究生培养单位的研究生教育管理工作，组织开展学科学位点的建设和培育工作。研究生学院设有学院办公室、培养办公室、管理办公室、学科建设办公室、学位建设办公室5个科室，学院现有职工12人。

我校于1979年开始招收硕士研究生，1981年被国务院学位委员会批准为首批硕士学位授予权单位。1981年神经病学、药理学获批硕士学位授予权，1986年生理学、1993年妇产科学、1996年外科学、1998年中西医结合基础、法医学获批硕士学位授予权。2000年成为临床医学硕士专业学位试点工作单位，2009年开始招收临床医学硕士专业学位研究生。2011年，获批生物学、基础医学、临床医学三个一级学科硕士学位授权。2013年成为教育部、国家卫计委首批“临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革”试点高校，2019年获批安徽省博士学位授予立项建设单位，2022年学校被评为省级研究生思想政治教育优秀高校，2024年获批安徽省博士学位授权立项重点建设单位。

现有基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学（授医学、理学学位）4个医学类，生物学1个理学类，马克思主义理论1个法学类一级学科硕士学位授权点；临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学5个医学类，应用心理1个教育学类硕士专业学位授权类别；中西医结合基础1个独立二级学科授权点。目前临床医学为安徽省高峰学科，基础医学、药学、公共卫生与预防医学为安徽省高峰培育学科，临床医学进入ESI全球排名前1%。目前学校在校硕士研究生1722名，现有硕士生导师1100余名，研究生联合培养基地52家，覆盖“长三角”主要城市和我省所有国家级住院医师规范化培训基地。现为安徽医科大学、山东大学、广州中医药大学、安徽中医药大学、安徽师范大学博士研究生联合培养单位，现有博士生导师23名。

在今后的研究生教育管理中，我校将立足当前实际、着眼未来发展，继续坚持“立德树人”根本任务，发挥创新引领核心作用，不断加强研究生思想政治教育，培养德才兼备创新人才。

（2024年3月更新）